Hvilket program kan jeg bruge til at se en .gfa-fil?

1. Hvordan åbner jeg en GFA-fil?
2. Hvad er GFA-fil?
3. Hvad er samlingsgraf?

Hvordan åbner jeg en GFA-fil?

Hvis du ikke kan åbne din GFA-fil korrekt, skal du prøve at højreklikke eller trykke langvarigt på filen. Klik derefter på "Åbn med", og vælg et program. Du kan også få vist en GFA-fil direkte i browseren: Træk bare filen i dette browservindue og slip den.

Hvad er GFA-fil?

GFA-formatspecifikationen. ... GFA-formatet er et tabulatorafgrænset tekstformat til beskrivelse af et sæt sekvenser og deres overlapning. Teksten er kodet i UTF-8, men har ikke tilladelse til at bruge en codepoint-værdi højere end 127. Linjens første felt identificerer linjetypen.

Hvad er samlingsgraf?

En samlingsgraf bruges til at repræsentere den endelige samling af et genom (eller metagenomer). Enkelt sagt bygger samleren denne samlingsgraf baseret på læsninger og deres overlapningsoplysninger. Endelig løser samleren stier på tværs af samlingsgrafen og udsender ikke-forgrenende stier som kontig.